Это Белгородский государственный университет, Иркутский государственный технический университет, Казанский государственный технологический университет, Мордовский государственный университет им. Н.П. Огарева, Московский государственный институт электронной техники, Московский государственный строительный университет (МГСУ), Московский энергетический институт (технический университет), Пермский государственный университет, Российский государственный медицинский университет федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию, Российский государственный университет нефти и газа им.И.М.Губкина, Санкт-Петербургский государственный политехнический университет, Саратовский государственный университет им.Н.Г.Чернышевского, Томский государственный университет, Учреждение Российской Академии наук Санкт-Петербургский академический университет - Научно-образовательный центр нанотехнологий РАН и Южно-Уральский государственный университет.

Отбор победителей осуществлялся из 32 финалистов; по основным критериям: современность и динамика развития учебных заведений, кадровый потенциал, инфраструктура образовательного процесса и научных исследований, эффективность образовательной и научно-инновационной деятельности, свидетельства международного и национального признания, качество, обоснованность и ожидаемая результативность представленной программы развития в соответствии с перечнем показателей и критериями оценки эффективности реализации программ развития университетов, утверждаемыми Министерством образования и науки Российской Федерации.

В первом конкурсном отборе, объявленном 1 августа 2009 года, приняли участие 110 университетов. Тогда конкурсной комиссией были выбраны 12 вузов-победителей.